I løpet av istiden, for rundt 25 000 år siden, gikk en is ned, som skapte Valdai-høyden med sine åser. De resulterende gropene begynte å fylles med smeltevann, og den berømte Seliger Lake ble født. Innsjøen har klart vann, som tilsvarer navnet, som i oversettelse fra finsk "selhea" betyr "rent, gjennomsiktig".
Innsjøen overrasker også med antall øyer som ligger på den, hvorav det er ca 169 stykker. Mange av dem er ikke så store i området (omtrent 10 meter i diameter), men den største er øya Khachin, hvor det er 13 egne innsjøer.
En like fantastisk og vakker legende ble dannet om den fantastiske innsjøen Seliger med sitt mangfold av øyer. Legenden forteller at i veldig eldgamle tider bodde brødrene-innsjøene Ilmen og Seliger på jorden. Brødrene hadde en Volga-søster som de var veldig glad i. Og på en eller annen måte ba Volga om å vise henne det Kaspiske hav, om hvis storhet hun hadde hørt. Brødrene kunne ikke nekte henne og lovet å oppfylle ønsket. De kom sammen på tur, men ble enige om å gå alle sammen og bare om dagen, for ikke å gå seg vill og ikke gå seg vill. Og slik ble det gjort, de fortsatte i flere dager. Men en natt våknet Ilmens bror og så at Seligers bror hadde lurt ham og reist i hemmelighet med søsteren. Bror Ilmen var sint for en slik svik, og forbannet ham for bedrag med følgende ord: “O bror Seliger som forrådte meg, jeg forbanner deg for din utroskap! Så la det være hundre knøl på ryggen! Gudene hørte ham, og for det faktum at Seliger brøt eden, oppfylte de forbannelsen til broren hans. Siden den gang har Seliger slitt et slikt antall pukkeløyer.
I dag har innsjøen en kystlinje på 590 kilometer. Vannområdet er 260 kvadratkilometer. Seliger har store og små strekninger, som er sammenkoblet av sund. Plyos er en relativt stor vannmasse som ligger mellom øyene.
Innsjøen har også sund, de smale kalles mellomstrømmer, de store kalles elver. Totalt antall søl er 23. Innsjøen har sandbunn. På grunn av de mange grunne som ligger ved sjøen, er det bare små båter som kan seile på den, men det er en stor depresjon, hvis dybde er 30 meter.
Selve innsjøen og de omkringliggende landskapene er fylt med fortryllende skjønnhet, så dette stedet er verdt et besøk.